DurdagiLab's profile picture. A computational biology laboratory, working areas are drug design/discovery, protein-drug and protein-protein interactions #durdagilab @TIPBAU @serdar_durdagi

Durdagi Lab

@DurdagiLab

A computational biology laboratory, working areas are drug design/discovery, protein-drug and protein-protein interactions #durdagilab @TIPBAU @serdar_durdagi

Durdagi Lab reposted

Our research paper with @HasanDeMirciLab at Structure is just published. Congratulations to all who contributed to this great work. authors.elsevier.com/sd/article/S09… @DurdagiLab @Structure_CP @TIPBAU #DrugDesign #DrugRepurposing #COVID19

serdar_durdagi's tweet image. Our research paper with @HasanDeMirciLab at Structure is just published. Congratulations to all who contributed to this great work. authors.elsevier.com/sd/article/S09… @DurdagiLab  @Structure_CP @TIPBAU #DrugDesign #DrugRepurposing #COVID19

Durdagi Lab reposted

Yeni makalemiz "Synthesis, molecular docking and molecular dynamics studies of novel tacrine-carbamate derivatives as potent cholinesterase inhibitors" medisinal kimyada prestijli dergilerden olan "Bioorganic Chemistry" de kabul edildi.

serdar_durdagi's tweet image. Yeni makalemiz "Synthesis, molecular docking and molecular dynamics studies of novel tacrine-carbamate derivatives as potent cholinesterase inhibitors" medisinal kimyada prestijli dergilerden olan "Bioorganic Chemistry" de kabul edildi.

Durdagi Lab reposted

Hasan Demirci Hoca ile ortak çalışmamız: "Near-Physiological-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystallography Reveals Novel Conformations of SARS-CoV-2 Main Protease Active Site for Improved Drug Repurposing" Structure dergisinde kabul edildi.

serdar_durdagi's tweet image. Hasan Demirci Hoca ile ortak çalışmamız: "Near-Physiological-Temperature Serial Femtosecond X-ray Crystallography Reveals Novel Conformations of SARS-CoV-2 Main Protease Active Site for Improved Drug Repurposing" Structure dergisinde kabul edildi.

Durdagi Lab reposted

Elucidation of Cryptic and #Allosteric Pockets within the SARS-CoV-2 Main #Protease pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… @Terrasztain @RommieAmaro #ASAP

JCIM_JCTC's tweet image. Elucidation of Cryptic and #Allosteric Pockets within the SARS-CoV-2 Main #Protease   
pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…    
@Terrasztain  @RommieAmaro  
#ASAP

Durdagi Lab reposted

Can Computational Models Predict Key Functional Elements in Large Macromolecular Complexes? YES! Our viewpoint with @Marcia_lincRlab & @JacopoManig Our models of 2018, today confirmed by cryo-EM structures! @JCIM_ACS @IITalk @embl @RNA_iit pubs.acs.org/doi/abs/10.102…


Durdagi Lab reposted

Identifying Conformational #Isomers of Organic Molecules in Solution via Unsupervised #Clustering pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… @matteoslvlgl #current_issue #compchem

JCIM_JCTC's tweet image. Identifying Conformational #Isomers of Organic Molecules in Solution via Unsupervised #Clustering  
pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…    
@matteoslvlgl 
#current_issue #compchem

Durdagi Lab reposted

28 Mayıs (Cuma), 17:00'de İstanbul Bilgi Üniversitesi'nin ev sahipliğini yapacağı webinar'da COVID-19'a karşı laboratuvarımızda gerçekleştirilen ilaç geliştirme çalışmalarını sunacağım. Seminer kaydı: us02web.zoom.us/webinar/regist…

serdar_durdagi's tweet image. 28 Mayıs (Cuma), 17:00'de İstanbul Bilgi Üniversitesi'nin ev sahipliğini yapacağı webinar'da COVID-19'a karşı laboratuvarımızda gerçekleştirilen ilaç geliştirme çalışmalarını sunacağım.  Seminer kaydı: us02web.zoom.us/webinar/regist…

Durdagi Lab reposted

Bazen gerçekler göz önündedir, ancak görmek için iyi bakmak gerekir. Buna çok güzel bir örnek, protein katlanma ve stabilite çalışmalarına yön verebilecek önemli bir çalışma: nature.com/articles/s4158…

serdar_durdagi's tweet image. Bazen gerçekler göz önündedir, ancak görmek için iyi bakmak gerekir. Buna çok güzel bir örnek, protein katlanma ve stabilite çalışmalarına yön verebilecek önemli bir çalışma: nature.com/articles/s4158…

Durdagi Lab reposted

Improved Protein–Ligand #Binding Affinity Prediction with Structure-Based Deep #Fusion Inference pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… #current_issue #MachineLearning #DeepLearning

JCIM_JCTC's tweet image. Improved Protein–Ligand #Binding Affinity Prediction with Structure-Based Deep #Fusion Inference  
pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…  
#current_issue #MachineLearning #DeepLearning

Durdagi Lab reposted

Orkide Coşkuner hoca ile ortak yayınımız "Structures of MERS-CoV Macro Domain in Aqueous Solution with Dynamics: Impacts of Parallel Tempering Simulation Techniques and CHARMM36m and AMBER99SB Force Field Parameters" PROTEINS'den az önce kabul aldı.

serdar_durdagi's tweet image. Orkide Coşkuner hoca ile ortak yayınımız "Structures of MERS-CoV Macro Domain in Aqueous Solution with Dynamics: Impacts of Parallel Tempering Simulation Techniques and CHARMM36m and AMBER99SB Force Field Parameters" PROTEINS'den az önce kabul aldı.

Durdagi Lab reposted

Fakültemiz Biyofizik ABD Başkanı Prof. Dr. Serdar Durdağı'nın yürütücülüğünü üstlendiği COVID-19 tedavisine yönelik proje kapsamında ilaç yeniden konumlandırma yaklaşımı ile belirlenen ilacın Faz-2 klinik çalışmaları için TİTCK'dan onay alındı. Hocamızı tebrik ediyoruz👏👏👏


Durdagi Lab reposted

Başta BAU Tıp Fakültesi Öğretim Üyesi Prof. Dr. Serdar Durdağı olmak üzere emeği geçenleri insanlık adına kutluyorum.


Durdagi Lab reposted

Bugun 14:00'de Gebze Teknik Üniversitesi Kimya Bölümü Online Seminerleri kapsamında COVID-19'a karşı sanal molekül kütüphanelerinin in siliko ve in vitro taranması konusunda bir seminer vereceğim.


Durdagi Lab reposted

Look at this! #comphem

Released today @EMDB_EMPIAR & @PDBeurope, & published @CellCellPress, the awesome 3.9 Å #CryoEM structure of the #Flagellar #Motor-Hook complex, the molecular machine that drives rotation of the #Flagellum for #Bacterial motility by Tan et al. from @ZJU_China 1/2



Durdagi Lab reposted

İlaç tasarımında hesaplamalı yöntemlerin yerini anlatıp tartışacağız iki gün. Bekleriz... indico.truba.gov.tr/event/37/overv… @serdar_durdagi @ozkirimli_elif @tuncadogan @midstlab @Ezgi_Karaca_ @TrubaUlakbim

cananatlgn's tweet image. İlaç tasarımında hesaplamalı yöntemlerin yerini anlatıp tartışacağız iki gün. Bekleriz... 

indico.truba.gov.tr/event/37/overv… 

@serdar_durdagi @ozkirimli_elif @tuncadogan @midstlab @Ezgi_Karaca_ @TrubaUlakbim

Durdagi Lab reposted

"İlaç Tasarımında Yüksek Başarımlı Hesaplama Teknolojileri Çalıştayı" 5-6 Mayıs 2021. Çalıştay'da "Molekülden İlaca: İlaç Yeniden Konumlandırma Süreçlerinde Sanal Molekül Tarama Algoritmalarının Geliştirilmesi" isimli bir sunum yapacağım. indico.truba.gov.tr/event/37/overv…

serdar_durdagi's tweet image. "İlaç Tasarımında Yüksek Başarımlı Hesaplama Teknolojileri Çalıştayı" 5-6 Mayıs 2021. Çalıştay'da "Molekülden İlaca: İlaç Yeniden Konumlandırma Süreçlerinde Sanal Molekül Tarama Algoritmalarının Geliştirilmesi" isimli bir sunum yapacağım. indico.truba.gov.tr/event/37/overv…

Durdagi Lab reposted

Structural and Functional Characterization of #Allatostatin Receptor Type-C of #Thaumetopoea_pityocampa, a Potential Target for Next-Generation Pest Control Agents pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… @AidaShahraki @serdar_durdagi #current_issue #Chemical_Information

JCIM_JCTC's tweet image. Structural and Functional Characterization of #Allatostatin Receptor Type-C of #Thaumetopoea_pityocampa, a Potential Target for Next-Generation Pest Control Agents  
pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… 
@AidaShahraki @serdar_durdagi 
#current_issue #Chemical_Information

Loading...

Something went wrong.


Something went wrong.