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Original strategies for training and educational initiatives in bioinformatics, Volume II frontiersin.org/research-topic…
frontiersin.org
Original strategies for training and educational initiatives in bioinformatics, Volume II
Given the success of the previous Research Topic ‘'Original strategies for training and educational initiatives in bioinformatics', we are pleased to launch a second volume for further submissions....
A modelagem 3D de RNA é um processo que, apesar de ser bem pesquisado, requer a instalação de diversos pacotes e bibliotecas. Por isso, @MarcinMagnus criou o rna-tools.online, em #Python, uma plataforma web que facilita o uso pelo usuário. Leia: bit.ly/3R0psU0
Hoje @vhfsantos colocou no ar a lista dos 40 selecionados para a 5ª edição do Workshop de Python para Dados Biológicos. Confiram aqui: wpdb2022.netlify.app/participantes/ #Python #Biociências #Programação #Workshop #Educação
18 materiais gratuitos e em português para aprender Python:
MatteoPalù et al. (2022) desenvolveram o KEMET, uma ferramenta implementada em #Python com objetivo de avaliar módulos KEGG e expandir a anotação de genomas microbianos por buscas direcionadas com sequências ortólogas.
A utilização de #MachineLearning em #Python se tornou muito importante e muitos usam suas ferramentas para solucionar problemas. @miguelprocha et al. criaram o ProPythia, um pacote focado na manipulação e classificação de proteínas. bit.ly/3O3pbyI
Manish Goel e Korbinian Schneeberger desenvolveram o plotsr uma ferramenta implementada em #Python via #CLI, que permite a visualização de forma simples e flexível de semelhanças estruturais e grandes rearranjos entre múltiplos #genomas. Veja mais: bit.ly/3sA5NR5
A construção de arquiteturas 3D de RNA podem ser representadas por grafos, permitindo usar sua teoria e trabalhar com #MachineLearning. Para facilitar seu uso, Mallet et al. criaram com #Python um pacote que facilita a análise e visualização de RNAs. bit.ly/38ApVvn
Pesquisadores associados à @EdinburghUni desenvolveram o PyGNA, #API em #Python, com o qual é possível reunir análises estatísticas em redes biológicas e conjuntos de genes, determinando a interação entre eles. Disponível em bit.ly/3NAO8kU
O grupo @KlingmuellerG elaborou o pacote #MSPypeline em #Python. Esse conjunto de ferramentas auxilia os usuários na análise de dados #proteômicos, fornecendo um processamento abrangente e conclusivo em minutos. Disponível em bit.ly/368VlI2
ExTaxsI consiste em uma ferramenta de #bioinformática de código aberto implementada em #Python, desenvolvida por @agostinetto_g et. al (2022). facilita a integração e a exploração de informações moleculares e de dados taxonômicos. bit.ly/3MAMU98
Todas as quartas-feiras às 11h30 fazemos um code club de programação em #Julia, aplicando em exemplos biológicos. Hoje, trabalhamos com a análise de frequência de nucleotídeos (A,C,T,G) em sequência de DNA (preparado pelo mestrando Pedro Ilídio e com colaboração do @eliascarvdev)
@GuillemSalazar et al. desenvolveram uma ferramenta em #Python chamada mTAGs, que consiste em um perfilador taxonômico para #metagenomas. Ele classifica as sequências a partir do consenso degenerado das referências de genes de RNA ribossômico. bit.ly/3ubFP81
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