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ComputerChem's profile picture. 計算化学好きの JK。 九九六労働推奨。週七労働は非推奨。 Qiitaリンク https://qiita.com/ComputerChem

計算化学.com

@ComputerChem

計算化学好きの JK。 九九六労働推奨。週七労働は非推奨。 Qiitaリンク https://qiita.com/ComputerChem

84โพสต์ 2พันผู้ติดตาม 241กําลังติดตาม
คุณอาจชื่นชอบ
ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
12 พ.ย.

研究者本人の解説はとても勉強になる。あとがきも面白いし、為になる。

cuemolnohito's profile picture. 東京科学大・難治研/生体分子の立体構造とシミュレーション・深層学習/メンバー募集中(https://t.co/NSrR73gTGQ)/CueMolという生体高分子の構造可視化ソフトウェアを作っています．
きゅうもるの中の人
 @cuemolnohito
12 พ.ย.

先日掲載された論文、Improving Stereochemical Limitations in Protein–Ligand Complex Structure Predictionの解説ブログを書きました！ cddlab.io/blog/2025/11/1…

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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
12 พ.ย.

ColabReaction の論文が JCIM に掲載されました。 表紙にも選出されたようです。 preprint よりも加筆されており、ローカル環境へのインストール方法も書かれています。

ForecastBiosyn's profile picture. 学術変革A－予知生合成科学の関連情報をお伝えするアカウントです。
学術変革A－予知生合成科学
 @ForecastBiosyn
11 พ.ย.

The Terada (A02) and Leow (A02) groups have developed ColabReaction, a cloud-based tool that accelerates transition-state searches using the machine learning potential UMA. This work was featured as a journal cover. available at: colabreaction.net pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…

ForecastBiosyn's tweet image. The Terada (A02) and Leow (A02) groups have developed ColabReaction, a cloud-based tool that accelerates transition-state searches using the machine learning potential UMA. This work was featured as a journal cover. available at: colabreaction.net pubs.acs.org/doi/10.1021/ac…
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cuemolnohito's profile picture.
きゅうもるの中の人
 @cuemolnohito
5 พ.ย.

研究室ブログを更新しました！ cddlab.io/blog/2025/11/0…

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計算化学.com รีโพสต์แล้ว
cuemolnohito's profile picture.
きゅうもるの中の人
 @cuemolnohito
30 ต.ค.

研究室のページにブログを作ってみました。ぼちぼち更新していければと思います。cddlab.io/blog/2025/10/2…

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計算化学.com รีโพสต์แล้ว
Ag_smith's profile picture.
Yoshitaka Moriwaki
 @Ag_smith
29 ต.ค.

ColabReaction: Accelerating Transition State Searches with Machine Learning Potentials on Google Colaboratory pubs.acs.org/doi/10.1021/ac… J. Chem. Inf. Model. October 28, 2025

Ag_smith's tweet card. We have developed a rapid and automated transition state (TS) search method for chemical reactions by combining the double-ended method, Direct MaxFlux (DMF), with machine learning (ML) potentials....
ColabReaction: Accelerating Transition State Searches with Machine Learning Potentials on Google...
แหล่งที่มา: pubs.acs.org
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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
11 ต.ค.

Microsoft が発表した 機械学習汎関数 Skala の使い方です。PySCF で動かすことができます。 現時点では、限定された用途での使用になってしまうようです。 qiita.com/ComputerChem/i…

ComputerChem's tweet card. 概要 Microsoft 社が開発した機械学習汎関数 Skala の使用方法 Skala は機械学習ポテンシャルではなく、DFT 計算用のディープラーニングベースの交換相関汎関数。 ) と書かれているので、機械学習ポテンシャルのように一瞬で計算が完了するわけ...
機械学習汎関数 Skala の使い方 - Qiita
แหล่งที่มา: qiita.com
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shin1koda's profile picture.
Shin-ichi Koda
 @shin1koda
1 ส.ค.

ロバストな遷移状態探索法を作っています。 ✅多自由度系・大規模構造変化を伴う反応に対応 ✅既存手法が失敗する反応でも多くのケースで容易に即座に探索可能 ✅ColabReactionにも採用 （左：既存手法、右：開発手法） 既存ソフトでお困りの際はぜひご相談ください🧑‍💻

shin1koda's tweet image. ロバストな遷移状態探索法を作っています。 ✅多自由度系・大規模構造変化を伴う反応に対応 ✅既存手法が失敗する反応でも多くのケースで容易に即座に探索可能 ✅ColabReactionにも採用 （左：既存手法、右：開発手法） 既存ソフトでお困りの際はぜひご相談ください🧑‍💻
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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
16 ก.ค.

従来のDFT計算より100倍以上高速なのに同等の精度で遷移状態構造探索を行うことができるクラウドベースの無料の計算ツール ColabReaction が東京大学の研究グループから発表されました。 colabreaction.net で誰でも無料で使用可能です。 プレプリント: chemrxiv.org/engage/chemrxi…

ComputerChem's tweet image. 従来のDFT計算より100倍以上高速なのに同等の精度で遷移状態構造探索を行うことができるクラウドベースの無料の計算ツール ColabReaction が東京大学の研究グループから発表されました。 colabreaction.net で誰でも無料で使用可能です。 プレプリント: chemrxiv.org/engage/chemrxi…
ForecastBiosyn's profile picture. 学術変革A－予知生合成科学の関連情報をお伝えするアカウントです。
学術変革A－予知生合成科学
 @ForecastBiosyn
16 ก.ค.

The Terada group (A02), in collaboration with Dr. Leow (A02), has developed ColabReaction — a cloud-based tool for accelerated transition state searches using Direct MaxFlux (DMF) and the ML potential (UMA) available at: colabreaction.net preprint: chemrxiv.org/engage/chemrxi…

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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
15 ก.ค.

Nvidia と Schrödinger の共同研究って強すぎ。アカデミアじゃ太刀打ちできない。

NVIDIAHealth's profile picture. The official handle for #NVIDIAHealthcare. Helping the scientific and developer community advance research, diagnostics, and patient care with #AI.
NVIDIA Healthcare
@NVIDIAHealth
15 ก.ค.

In collaboration with @schrodinger, we present DualBind trained on ToxBench 📚 8,770 ERα AB-FEP predicted complexes (RMSE ≈ 1 kcal mol⁻¹). At last, ML has the signal to learn true binding physics - DualBind already hits r = 0.84 without shortcuts. How could this reshape…

NVIDIAHealth's tweet image. In collaboration with @schrodinger, we present DualBind trained on ToxBench 📚 8,770 ERα AB-FEP predicted complexes (RMSE ≈ 1 kcal mol⁻¹). At last, ML has the signal to learn true binding physics - DualBind already hits r = 0.84 without shortcuts. How could this reshape…
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takeyaburinC's profile picture.
竹薮林
 @takeyaburinC
7 ก.ค. 2024

今年のお願い

takeyaburinC's tweet image. 今年のお願い
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sokrypton's profile picture.
Sergey Ovchinnikov
 @sokrypton
3 ก.ค.

CASP is getting cut by NIH... 😢 (Anyone with extra funds wanna help support perhaps the most important competition of the century?) science.org/content/articl…

sokrypton's tweet card. Agency silent on funding renewal for contest that inspired creation of AIs that predicted how proteins would fold
Exclusive: Famed protein structure competition nears end as NIH grant money runs out
แหล่งที่มา: science.org
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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
9 มิ.ย.

先月発表された meta の OMol25 を利用した遷移状態構造探索手法が東大のグループから発表されました。 従来の DFT 計算よりも 100 倍以上早いのに同等の精度(MAE = 1.65 kcal/mol, average RMSD = 0.24 Å)。

ForecastBiosyn's profile picture. 学術変革A－予知生合成科学の関連情報をお伝えするアカウントです。
学術変革A－予知生合成科学
 @ForecastBiosyn
9 มิ.ย.

The Terada group (A02) developed a novel terpene analysis approach that is high-speed, high-accuracy, and high-resolution by combining the Direct MaxFlux method with machine learning (ML) potentials. chemrxiv.org/engage/chemrxi… DOI:10.26434/chemrxiv-2025-md8k6

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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
30 พ.ค.

Gaussian 正常終了時に表示されるポエムに登場する ZAK とは何者なのでしょうか？ qiita.com/ComputerChem/i…

ComputerChem's tweet card. 概要 Gaussian の計算が正常終了すると、log ファイルの最後にポエムが書かれている。 さて、このポエムですが何種類あるのでしょうか？ I9999.F Gaussian のソースコードを見ると、その中に I9999.F という FORTRAN のファイルがある。...
Gaussian のポエム - Qiita
แหล่งที่มา: qiita.com
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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
22 พ.ค.

Ruibo Wu が開発した天然物生合成の "逆合成解析" ツール BioNavi のインストール方法と使い方。 BioNavi は、天然物の生合成経路を予測するための深層学習に基づく新しいツール。Transformer モデルと AND-OR 木に基づいた計画アルゴリズムを組み合わせている。 qiita.com/ComputerChem/i…

ComputerChem's tweet card. 概要 Ruibo Wu が報告した天然物の生合成の"逆合成解析"ツール BioNavi のインストールログ。 BioNavi は、天然物の生合成経路を予測するための深層学習に基づく新しいツール。Transformer ニューラルネットワークと AND-OR 木に基づいた計...
BioNavi のインストール方法「生合成の逆合成解析ツール 」 - Qiita
แหล่งที่มา: qiita.com
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ComputerChem's profile picture.
計算化学.com
 @ComputerChem
6 พ.ค.

ACS Spring 2025 Exhibition にて、Gaussian25 と GaussView7 が年末にリリースされると発表されたそうです。新機能などについてまとめました。 qiita.com/ComputerChem/i…

ComputerChem's tweet card. 概要 ACS Spring 2025 Exhibition にて、Gaussian25 と GaussView7 が年末にリリースされると発表された。サブスクリプション版への移行や新機能についても解説をつけた。 新機能 新機能は、以下の通り。 引用元：https:/...
Gaussian25 と GaussView7 - Qiita
แหล่งที่มา: qiita.com
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yoko_materialDX's profile picture. パナソニック ホールディングス株式会社 リードリサーチャー｜素材×DX（#マテリアルズインフォマティクス ）によるクリーンエネルギー材料の研究開発｜社会人博士課程修了｜計算材料科学、第一原理計算、機械学習｜その他の情報は個人HPへ｜会社の研修がきっかけで始めました｜発信内容は個人見解ですのでご了承ください

横山トモヤス｜計算材料科学者

@yoko_materialDX
chemstation's profile picture. Chem-Station（ケムステーション；ケムステ）は日本最大化学ポータルサイト。化学の話題をつぶやきます。化学好きの方フォローお願い致します。2017年度日本化学会化学教育賞・2019年文部科学大臣表彰科学技術賞受賞 [化学][ニュース][分子][Chemistry][News][Molecule]

Chem-Station

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morop_'s profile picture. 諸藤達也。有機化学論文研究所所長、教育系youtuber、花王＞学習院大助教＞化学メーカー　ブログ(https://t.co/pcYzVVFhIU)！ YouTube(https://t.co/1zRxrhzAlm)フォローお願いします！

もろぴー@書籍『超有機化学入門』買ってね☆

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Ag_smith's profile picture. とある文京区のラボォです。タンパク質の立体構造とバイオインフォマティクスに興味があります。I'm interested in protein bioinformatics. ORCID: 0000-0003-0448-9790

Yoshitaka Moriwaki

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organischchemie's profile picture. 製薬 / 創薬 / メドケム / 有機化学 / けもいんふぉマティクス フォロー リプはお気軽に 副作用ゼロのパリッと効くお薬-超薬を作りたい Medicinal Chemist, Organic Chemistry, Pharmaceuticals 論文情報の備忘録はこちら @TipsChem

超薬化学ちゃ

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souyakuchan's profile picture. 創薬なんもわからん #blockbustART (fan art tag) #blockbustART_AI (AI fan art tag)

叢雲くすり (創薬ちゃん)

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Chem_Wednesday's profile picture. 主に大学院生を対象として、化学に関する配信などをしています！博士（学術）です！Website: https://t.co/wPljkKhrR7

Chemistry Wednesday (けむすい)

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yosuke_sumiya's profile picture. 研究：山口大助教(2024.5〜)←九大助教←理研基礎特研←北大、量子化学/計算化学/速度論/反応経路探索/分子動力学/接着現象、趣味：合唱/テニス/柔道/ビール 計算化学の研究者をしています。 https://t.co/L4vCNVMjNh

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NaistMi's profile picture. 奈良先端科学技術大学院大学マテリアルズ・インフォマティクス研究室です。https://t.co/CKlRtjNvBe 前所属時の解説記事（漫画）：https://t.co/QpuqY4edM6 #マテリアルズ・インフォマティクス

NAIST MI-Lab

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dc1394's profile picture. JuliaとRubyが好きです。Rustも頑張りたい。元応用化学科の物理学徒見習い。数学ガチ初心者。新潟大学大学院博士後期課程在学中（専門は第一原理計算）。発達障害（自閉症スペクトラム）。自然・社会科学のどちらも好き。趣味は数値解析（数値計算）と投資信託投資です。

dc1394

@dc1394
chemiegg's profile picture. 理学博士 専門:Totalsynthesis/natural product chemistry 趣味:Logic, analytical philosophy, philosophy of science, Pragmatism #有機化学何もわからんの会

全合成たん

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K_Oisaki's profile picture. GroupLeader CCRI-@AIST_JP / DeputyDirector FoodMedOIL /SAB @ChemRxiv / DeputyDirector @chemstation / AssocProf @UNIV_TSUKUBA_JP / SynOrgChem, Catalysis, Protein

Kounosuke OISAKI | 生長 幸之助

@K_Oisaki
gainenz's profile picture. Ph.D.(学術)。幅広い情報サイト(のつもりでした)。★★"Blender講座"過去動画は下記リンク　　好き:Anaal Nathrakh

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TomiyaAkio's profile picture. 素粒子理論物理学者(格子QCD×機械学習)。著書 https://t.co/TMHGxz6pyO 大学教員, 学変A, 富岳成果創出x2 🐉🍕 #シン・仮面ライダー 人工知能監修, 博士(理学),サマチャレ2期,東女/京大/理研

富谷/東女/京大

@TomiyaAkio
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ノブ＠化学者／研究者の生き方を考える

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Tetsua_KING's profile picture. 職業：大学教員；専門：有機金属化学，錯体化学，均一系触媒，二酸化炭素；趣味：ビール、Twitter、X線結晶構造解析；所属：KTR48，S48会，閻魔の会。Professor; Organometallic Chemisrty; Homogeneous Catalysis; Carbon

Fujihara_Tetsu

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midoriakiyamaF's profile picture. Assistant Prof. at KyotoU. Organic chemistry, Fluorine, and Beer. 京都大学大学院分子工学専攻　今堀研究室　助教の秋山みどりです。研究活動と京都の美味しいもの(主にビールとそれに付随するもの)を紹介しています。

Midori Akiyama

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KiyoshiMIYATA_J's profile picture. 山口→京都(PhD)→New York (博士研究員、海外学振)→福岡(助教→准教授)/分光分析化学研究室/Ultrafast spectroscopy/京大藤子不二雄同好会/卓球/TeamGunblade/カラオケ/BEMANI English account：@KiyoshiMIYATA_E

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@sensukame
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ペロブスカイト若林

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@Wilhelm_yuna
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@cam_life
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Arwauwerc

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横山トモヤス｜計算材料科学者

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Chem-Station

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Ag_smith's profile picture. とある文京区のラボォです。タンパク質の立体構造とバイオインフォマティクスに興味があります。I'm interested in protein bioinformatics. ORCID: 0000-0003-0448-9790

Yoshitaka Moriwaki

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KentaroSato's profile picture. 製薬企業研究者からサイエンスライターに転身。大学や研究機関の広報などアカデミアにも片足を突っ込む。サイト「有機化学美術館」の中の人、折り紙と囲碁が趣味。著書に「医薬品クライシス」「炭素文明論」「ふしぎな国道」「世界史を変えた新素材」など。ライターとしての仕事→ https://t.co/rrlyoWX2yX

佐藤健太郎

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dc1394's profile picture. JuliaとRubyが好きです。Rustも頑張りたい。元応用化学科の物理学徒見習い。数学ガチ初心者。新潟大学大学院博士後期課程在学中（専門は第一原理計算）。発達障害（自閉症スペクトラム）。自然・社会科学のどちらも好き。趣味は数値解析（数値計算）と投資信託投資です。

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@dc1394
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Kounosuke OISAKI | 生長 幸之助

@K_Oisaki
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ChemEurJ: Chemistry - A European Journal

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m_sekijima's profile picture. 東京科学大学 情報理工学院 准教授/AI創薬/バイオインフォマティクス/ケモインフォマティクス/ 機械学習/分子動力学計算/（FAQ:手に持っているのはメートル原器です） https://t.co/JcwitMHkLa https://t.co/LWb3AfC2Zc

Masakazu Sekijima

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sinOrganicChem's profile picture. 反応機構についての動画を投稿しています！化学系大学生のお役に立てれば嬉しいです！時々無作為に化学系っぽい方をフォローしています。#院試 #編入 #化学科 #有機化学 #反応機構

sin有機化学

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Hishinuma_t's profile picture. 博士(情報学)，疎行列とHPCが専門，エルデシュ数4，SB Intuitions←braid← 某スマホメーカ ← RICOS ← PEZY Computing．数値計算の専門家だった。 ゴマちゃんと妻と娘が好き．発言は所属と関係ない

電子計算機の沼

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SpecChem_Kyushu's profile picture. 九州大学大学院 理学研究院 化学部門にある分光分析化学研究室のアカウントです。主に超高速分光を武器に、世界第一線の分光学・材料化学の研究を展開しています。 このアカウントでは、研究室の日常や、超高速分光、光化学、分子科学などに関する情報発信をしていきたいと思います。気軽にフォローいただけたら幸いです！

分光分析化学研究室＠九州大学

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tugutuguk's profile picture. 光合成をやめた植物（菌従属栄養植物、腐生植物、寄生植物）研究者。神戸大学理学部教授（兼・高等学術研究院卓越教授）。専門は、植物、昆虫やキノコの自然史（生態や進化）。変わった生物に心惹かれますが、特にラン科植物が大好き。学振応募者や共同研究者を募集中。『「植物」をやめた植物たち（たくさんのふしぎ傑作集）』好評発売中！

末次 健司

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